 
    技術文章
 更新時間:2023-09-12
更新時間:2023-09-12 點擊次數:1337
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        實驗室常用 DNA 聚合酶有三種:TaqTM , EXTaqTM 和 Pyrobest TM DNA Polymerase。TaqTM 是一般的 DNA 聚合酶, 保真性較差 , 但價錢便宜, 一般用于基因表達的檢測等。TaKaRa EXTaqTM 是具有 Proofreading 活性的耐熱性 DNA 聚合酶, 具有一定的保真性, 而且其擴增得到的 PCR 產物 3 ’ 端附有一個 “A" 堿基 ,如果希望直接將產物克隆 到 T-vector 可以用此酶 。 Pyrobest TM DNA Polymerase 也是具有 Proofreading 活性的耐熱性 DNA 聚合酶, 其特點是保真性高,擴增得到的 PCR 產物為平滑末端。如果進行基因的擴增請使用此酶。
1. 按下列組成在 PCR 反應管中調制反應液:
TaKaRa TaqTM 或 TaKaRa EXTaqTM 的配方
| Reagent | Quantity, for 50µl of reaction mixture | 
| 10X PCR buffer (Mg2+ free) | 5 µ l | 
| 
 MgCl2(25mM) | 如 TaKaRa TaqTM 加 3 µl | 
| 如 TaKaRa EXTaqTM 加 4 µl | |
| 2.5mM dNTP mix | 4 µ l | 
| 10µM Primer 上游 | 1 µ l | 
| 10µM Primer 下游 | 1 µ l | 
| Template DNA | 1 µ l | 
| Taq 或 EXTaqDNA Polymerase | 0.25 µl | 
| Sterile deionized water | Up to 50µl | 
| Total | 50 µl /Sample | 
merase 的配方
| Reagent | Quantity, for 50µl of reaction mixture | 
| 10X Pyrobest buffer | 5µ l | 
| 2.5mM dNTP mix | 4µ l | 
| 10µM Primer 上游 | 1µ l | 
| 10µM Primer 下游 | 1µ l | 
| Template DNA | 1µ l | 
| Pyrobest TM DNA Polymerase | 0.25µl | 
| Sterile deionized water | Up to 50µl | 
| Total | 50µl /Sample | 
① 反應總體積根據實際情況進行調控,可以做 20~50µl 以節約試劑;
② 將上表各成分加入到 0.2ml 或 0.5ml 滅菌的 PCR 薄壁管中;
③ 如果不用 PCR 儀的加熱蓋,在反應混合液的上層加 30 ~50µl 的礦物油防止樣品在 PCR 的過程中蒸發;
 
2. 按以下程序進行 PCR 擴增。
PCR 反應條件視模板、引物等的結構條件不同而各異, 在實際操作中需根據具體的情況以及 PCR 結果而進行優化。
| 
 Step | Temperature, ° C | 
 Time, min | Number of cycles | Note | 
| 起始變 性 | 
 94~95 | 
 1-3 | 
 1 | |
| 變性 | 94~95 | 0.5-2 | 
 
 
 
 25-35 | 退火溫度比理論退火 溫度大概低 5°C ,再 根據反應結果優化 | 
| 
 退火 | 
 37-70 | 
 0.5-2 | ||
| 
 延伸 | 
 70-75 | 根據擴 增產物 的大小 | 每分鐘延伸 1000bp | |
| 最終延 伸 | 
 70-75 | 
 10 | 
 1 | 
反應結束后,抽取擴增樣品 5µl,用瓊脂糖凝膠電泳分析擴增結果,用 DNA marker 判斷擴增片段的大小或冷凍保存,以備以后分析使用。
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